ח"כ זבולון כלפה (הבית היהודי) מכהן בין שאר תפקידיו כחבר המועצה הציבורית של יד בן צבי. לפני כחודש הוא קרא כאן דיווח בדבר הטייה פוליטית בכנס שערך המוסד במושבים שעסקו בו בנושא הר הבית. כלפה מיהר לכתוב לראשי המוסד מכתב מחאה. בתשובה לדבריו נכתב בין היתר: "כמוסד מחקר ממלכתי ומדעי, מקפידה למלא תפקידה בנאמנות תוך מתן כבוד למגוון דעות ולהצגת חידושי מחקר נדרשים ושונים בתחום חשוב זה של חקר ירושלים".